浙大夏令营实习一月游·一点技术

浙大为期一个月的实习生活记录
实习内容:
光学显微镜下神经元图像自动分割系统

参考论文:
Flood filling networks
Learning from Simulated and Unsupervised Images through Adversarial Training
High-precision automated reconstruction of neurons with flood-filling networks

项目核心内容:
使用simulator生成神经图像
将生成神经图像通过SimGAN,使之与真实神经图像相似,产生大量已标注数据集
将数据集通过FFN网络,实现自动分割

第一天

导师见面,选题分组,拷到simulator的代码,下载fiji查看3d神经数据,看论文

第二天

看论文

第三天

学长带领进行小组讨论,确定第一步实验内容,完成3d神经图像小块分割代码

第四天

github下载SimGAN代码,将keras版本转化tensorflow版本,编写refiner和disciminator代码
github地址:https://github.com/mjdietzx/SimGAN
CSDN地址:https://blog.csdn.net/omnispace/article/details/78256191

第五天

完成SimGAN剩余部分,预训练,history_buffer,优化器,模型可以成功运行

第六天

SimGAN模型有训练效果

第七天

休息

第八天

SimGAN在MNIST上成功运行,效果良好

第九天

准备3D神经数据

第十天

SimGAN在三维图像上成功运行,但参数有问题

第十一天

SimGAN在三维图像上可以训练

第十二天

大批量的测试,寻找最优参数

第十三天-第二十一天

一直在调参

第二十二天-第二十九天

学长给出flood filling network的代码,各种采坑后运行。组内答辩小组第一出线。

第三十天

学院面试,第五组第十二个。

漫长的一个月后的结果,换来一个浙大直博的offer,很是满意了。

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